Der Bau der Kirche und des Klosters an der Seite wurde vom Karmeliterorden begonnen, und die erste Messe wurde am 25. Mai 1268 gefeiert, noch bevor die Kirche fertiggestellt war.
Die Gebäude wurden einer Reihe von Veränderungen unterzogen, die ihr Erscheinungsbild radikal veränderten. Im Jahre 1330 wurde die Kirche durch ein Feuer fast vollständig zerstört und teilweise wieder aufgebaut, bevor sie von den Karmeliten, die sich anderswo bewegten, aufgegeben wurde. Die Pläne für den Wiederaufbau begannen 1400 und die Arbeiten begannen unter der Herrschaft von Gian Galeazzo Visconti. Als sich die Gebäude 1446 jedoch in einem fortgeschrittenen Stadium befanden, brachen sowohl die Kirche als auch das Kloster zusammen.
Der Architekt Pietro Antonio Solari wurde 1449 mit dem Wiederaufbau beauftragt. Das Gewölbe und die heute sichtbaren äußeren Teile des Querschiffs sind auf diese Zeit zurückzuführen. Im Jahr 1654 begannen umfangreiche Renovierungsarbeiten an der Etage, dem Turm und der Haupttür.
Die Kirche war anfangs der Verkündigung gewidmet, wie die beiden Reliefs neben dem Haupttor zeigen. Später erhielt sie den Namen Kirche der Reinigung, bevor sie Santa Maria del Carmine gewidmet wurde. Es war lange Zeit ein Bezugspunkt für einige wichtige Orden, wie die berühmte und mächtige „Schule des Gewandes von Karmel“, die in der ersten Zeit (bis 1391) mit der „Erzbruderschaft von Pula“ um Primat kämpfte die Gläubigen der Reinigung. “Der 1664 von Sandrini initiierte Glockenturm wurde im 18. Jahrhundert von den Österreichern in der Höhe reduziert. Die Sonntagsmesse umfasst drei Gottesdienste in englischer Sprache, um 8.30 Uhr a. m., 10,30 a. m. und 4.30 p. m. Am Donnerstag um 5 p. m. Es gibt Messen in Englisch und Tagalog, wobei letzteres die wichtigste Sprache ist, die in der Philippinischen Republik gesprochen wird. Die Fassade ist ein schönes Beispiel für die neugotische Kunst der Lombardei, ganz in Ziegel und Terrakotta. Der Bau begann 1673 und wurde erst 1883 nach einem Entwurf von Antonio Pozzone abgeschlossen. Carlo Maciachini modifizierte es erheblich, und diese Veränderungen wurden von zeitgenössischen Gelehrten heftig kritisiert.