L'église de San Calimero a un style linéaire élégant et sombre. Au fil des siècles, les architectes sont intervenus à de nombreuses reprises sur la structure et, de nos jours, ce que nous admirons est principalement le résultat de la transformation majeure qui a eu lieu à la fin du XIXe siècle, fruit du travail de l'architecte Angelo Colla la pureté romane originelle. L'intérieur est une seule nef de forme rectangulaire avec un toit qui était à l'origine fermé à la fermeture tandis que la division en travées couvertes de voûtes oblongues appartient à une phase successive qui ne peut être déterminée avec précision en raison de toutes les reconstructions du bâtiment.
Il reste encore des traces de la phase romaine du bâtiment. ils n'ont pas été annulés par les modifications fréquentes et les restaurations des époques successives. Celles-ci se trouvent du côté sud de l'abside, ouvertes par trois larges fenêtres cintrées caractérisées par la présence des arcs supérieurs. La première restauration majeure a eu lieu au XVIIe siècle, lorsque les travaux ont été confiés à l'architecte Francesco Maria Richini. Le XVIIIe siècle a laissé son empreinte avec les riches décorations en marbre offertes par la Confraternité du Saint-Sacrement et par l'oratoire de Saint-Michel qui, de nos jours, est utilisée comme sacristie. L'autel principal, aux lignes néoclassiques élégantes, date du début du XIXe siècle. L'église est dédiée à un noble de San Calimero qui, après un voyage à Rome, a été consacré au sacerdoce.
C'était un contemporain de S. Castriziano et il lui a succédé en tant qu'évêque. L'histoire déclare que San Calimero était un martyr puisqu'il a été jeté à mort dans un puits par des païens. L'emplacement dans lequel la basilique a été érigée était autrefois un lieu de sépulture en dehors des murs de la ville: toujours aujourd'hui, sur les murs du côté droit de l'église, se trouvent des pierres tombales païennes et chrétiennes de l'ancienne nécropole. Le récit transmis à travers les siècles dit que San Calimero a été enterré ici et que l'église lui a été dédiée, probablement de l'époque de l'évêque Ambrogio et probablement d'un cimetière basilique au moins jusqu'au XIIIe siècle. Il semble que la basilique ait été construite, au Vème siècle, sur les vestiges d'un temple dédié à Apollon, comme le dit une chronique des IXe-Xe siècles.