Музей епархии является важным учреждением для тех, кто хочет открыть для себя значительную часть истории Милана. Фактически, чтобы составить точную картину города, важно взглянуть на глубоко религиозную составляющую, лежащую в основе социальной и культурной структуры Милана.
Музей представляет историю и искусство в виде последовательности выставок, проходящих через последовательные периоды и стили, выражая единую историческую и церковную идентичность.
Например, часть выставки посвящена святому Амвросию, покровителю города. Этот раздел начинается с группы работ из базилики Сант-Амброджио, серии предметов, связанных с историей церкви и великого святого Милана.
Коллекция золотых картин А. Креспи абсолютно великолепна и представляет собой уникальное наследие миланских музеев, важный пример работы специалиста-коллекционера. Этот тип коллекции является хорошим примером коллекционирования произведений искусства в Ломбардии, с очень культурным подходом и посвящением внимания как местных художников, так и художников из других городов. Эта коллекция включает около сорока работ на панно, написанных в 1300-х и 1400-х годах, в основном в Тоскане и Умбрии; поэтому они важны для развития итальянской живописи.
Музей находится в ведении Фонда Сант Амброджо, представители которого назначаются архиепископом Милана. Структура является частью Амброзийской епархии, и она была сформирована с целью сохранения и развития художественного наследия епархии. Первая идея музея возникла в 1931 году, когда архиепископ Милана Блаженный Ильдефонсо Шустер написал письмо духовенству под названием «За священное искусство и епархиальный музей». Это предложение было принято только в 1960 году, когда кардинал Джован Баттиста Монтини, впоследствии ставший папой Павлом VI, подписал соглашение между архиепископством и муниципалитетом Милана, согласно которому монастыри Сант-Эусторджо должны были быть восстановлены для нового музея. Но проект начался только в 1980-х годах, когда кардинал Карло Мария Мартини запустил проект по реконструкции и адаптации монастырей для музея. Дизайн был заказан Lodovico Barbiano di Belgiojoso. Епархиальный музей был открыт 5 ноября 2001 года.
Вся коллекция насчитывает около 600 произведений, из которых около 400 выставлены, разделены на секции.