21 lutego 1552 r. Położono kamień węgielny i rozpoczęto budowę klasztoru oraz kościoła S. Angelo. Na zlecenie gubernatora Ferrante Gonzagi, kościół zastąpił tytułowy kościół, który został zburzony, jak to było na trasie planowanej dla nowych murów miejskich. Domenico Giunti, twórca projektu, zaprojektował kościół w kształcie krzyża łacińskiego składający się z pojedynczej nawy pod sklepionym sufitem ozdobionym motywami geometrycznymi. Na przestrzeni wieków liczne kaplice po bokach nawy wzbogaciły się o wiele dzieł sztuki, które zostały utracone po stłumieniu. Również klasztor, który pierwotnie miał trzy krużganki, każdy ozdobiony ważnymi cyklami obrazów, został zniszczony po stłumieniu: w rzeczywistości klasztor był wykorzystywany jako prywatny dom, a dwa inne zostały zburzone z powodu ich stanu ruiny. Obecny klasztor został zbudowany w ubiegłym wieku przez architekta Giovanniego Muzio.
W okresie dwóch stłumień w XIX wieku klasztor św. Anioła został wyczyszczony, a państwo przekazało pomieszczenia Trybunałowi Wojskowemu, dlatego wielki kościół stał się stajnią dla koni. Kompleks został następnie wykupiony w 1922 roku.
Na zielonym placu przed kościołem stoi fontanna S. Francesco rozmawiająca z ptakami. Pomnik zdobią wersety Kantyku wszystkich stworzeń.