Bracia Mniejsi kapucyni, którzy należą do zakonu, który jest obecny w Lombardii od 1535 r., Zdobyli uznanie ludności za ich pracę na rzecz ludzi z dnia na dzień. W szczególności w Mediolanie stali się czymś w rodzaju instytucji. Bracia, którzy angażują się w działalność charytatywną i są również wrażliwi na piękno, stworzyli muzeum, które prezentuje głównie dzieła religijne. Dziedzictwo Zakonu jest zatem udostępniane wszystkim, odzwierciedlając słowa fr. Galdino w słynnym cytacie autora Alessandro Manzoniego: „Jesteśmy jak morze, które otrzymuje napływ z całego świata i które rozprowadza to, co otrzymało daleko”. Z tego powodu wstęp do muzeum jest bezpłatny. Goście, którzy tego chcą, mogą przekazać darowiznę na wsparcie prac Muzeum.
Jedna ze zbiorów Muzeum to studium ikonograficzne św. Franciszka z Asyżu, założyciela rodziny franciszkańskiej, do której należą Bracia Mniejsi. Muzeum zachowuje dzieła o znacznej wartości, takie jak Welon Weroniki Guercino (początek XVII wieku) i Via Crucis (Stacje drogi krzyżowej) Giovanniego Domenico Tiepolo (1749).